Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ckap2lQ7TS74 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ckap2lQ7TS74 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms