Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp397Q7TNK4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms