Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dsg4Q7TMD7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dsg4Q7TMD7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms