Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vma21Q78T54 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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