Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rph3alQ768S4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rph3alQ768S4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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