Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnih3Q6ZWS4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnih3Q6ZWS4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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