Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LcorQ6ZPI3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LcorQ6ZPI3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms