Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Asic3Q6X1Y6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asic3Q6X1Y6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms