Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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