Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P4ha3Q6W3F0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P4ha3Q6W3F0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P4ha3Q6W3F0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms