Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja6Q6S5G4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms