Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gramd2bQ6PEM6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms