Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms