Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms