Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gapvd1Q6PAR5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gapvd1Q6PAR5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms