Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nomo1Q6GQT9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms