Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cep170Q6A065 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cep170Q6A065 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms