Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrcc1Q69ZB0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms