Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3ipQ68EF0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab3ipQ68EF0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms