Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Top2bQ64511 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Top2bQ64511 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Top2bQ64511 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms