Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms