Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim24Q64127 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms