Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Defa17Q64016 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Defa17Q64016 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Defa17Q64016 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Defa17Q64016 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Defa17Q64016 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Defa17Q64016 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Defa17Q64016 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Defa17Q64016 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Defa17Q64016 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa17Q64016 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms