Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zic2Q62520 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms