Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga3Q62470 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms