Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm20917Q62457 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm20917Q62457 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm20917Q62457 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm20917Q62457 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Gm20917Q62457 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm20917Q62457 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm20917Q62457 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20917Q62457 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20917Q62457 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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