Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CcncQ62447 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms