Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rbm38Q62176 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rbm38Q62176 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rbm38Q62176 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rbm38Q62176 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rbm38Q62176 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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