Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dsg1aQ61495 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dsg1aQ61495 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms