Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vsx2Q61412 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vsx2Q61412 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms