Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnna2Q61301 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms