Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lamb3Q61087 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lamb3Q61087 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms