Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf1Q61069 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf1Q61069 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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