Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxd3Q61060 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms