Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TmpoQ61033 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms