Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk2a1Q60737 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csnk2a1Q60737 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms