Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClpbQ60649 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms