Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Xrcc1Q60596 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Xrcc1Q60596 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms