Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a6Q5U4D8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms