Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc125Q5U465 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms