Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnajc11Q5U458 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms