Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam71bQ5STT6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms