Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC3

Ms4a13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a13Q5FWC3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ms4a13Q5FWC3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a13Q5FWC3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms