Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syce1lQ5D525 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syce1lQ5D525 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms