Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ndufaf2Q59J78 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndufaf2Q59J78 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms