Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpjQ569L8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpjQ569L8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms