Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdv3Q4VAA2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdv3Q4VAA2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms