Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srek1ip1Q4V9W2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms