Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm527Q4KL13 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms