Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc43Q3V0L5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
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